Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms