Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA3Q96EY1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms