Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF31Q8WWY3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms