Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREML1Q86YW5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms