Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC80Q76M96 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC80Q76M96 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC80Q76M96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC80Q76M96 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC80Q76M96 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC80Q76M96 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms