Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN12Q6ZSI9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms