Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HACD2Q6Y1H2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms