Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms