Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GREB1Q4ZG55 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms