Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC153Q494R4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms