Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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KRTAP21-1Q3LI58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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KRTAP21-1Q3LI58 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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