Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms