Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYPL1Q16563 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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