Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD6Q15008 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD6Q15008 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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