Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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COL9A2Q14055 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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COL9A2Q14055 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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