Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN2Q12907 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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