Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL38P63173 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL38P63173 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL38P63173 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL38P63173 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL38P63173 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL38P63173 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL38P63173 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL38P63173 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL38P63173 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL38P63173 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL38P63173 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL38P63173 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms