Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL7AP62424 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL7AP62424 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL7AP62424 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms