Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF6P49848 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF6P49848 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF6P49848 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF6P49848 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF6P49848 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF6P49848 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF6P49848 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF6P49848 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF6P49848 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF6P49848 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF6P49848 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF6P49848 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF6P49848 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF6P49848 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF6P49848 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF6P49848 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF6P49848 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF6P49848 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF6P49848 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF6P49848 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF6P49848 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF6P49848 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF6P49848 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms