Protein–RNA interactions for Protein: P46777

RPL5, 60S ribosomal protein L5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P46777 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL5P46777 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL5P46777 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL5P46777 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL5P46777 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL5P46777 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL5P46777 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL5P46777 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL5P46777 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL5P46777 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL5P46777 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL5P46777 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL5P46777 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL5P46777 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL5P46777 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL5P46777 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms