Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP62P37198 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP62P37198 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP62P37198 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP62P37198 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP62P37198 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP62P37198 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP62P37198 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP62P37198 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP62P37198 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP62P37198 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP62P37198 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP62P37198 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP62P37198 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms