Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA5P30532 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA5P30532 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA5P30532 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA5P30532 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA5P30532 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA5P30532 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms