Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTGFP29279 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTGFP29279 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTGFP29279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTGFP29279 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTGFP29279 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTGFP29279 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTGFP29279 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTGFP29279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTGFP29279 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTGFP29279 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTGFP29279 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTGFP29279 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTGFP29279 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTGFP29279 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTGFP29279 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTGFP29279 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTGFP29279 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTGFP29279 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTGFP29279 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTGFP29279 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTGFP29279 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTGFP29279 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTGFP29279 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTGFP29279 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTGFP29279 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTGFP29279 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTGFP29279 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTGFP29279 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTGFP29279 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTGFP29279 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTGFP29279 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTGFP29279 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTGFP29279 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTGFP29279 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms