Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA1P27694 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA1P27694 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA1P27694 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA1P27694 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA1P27694 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA1P27694 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA1P27694 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA1P27694 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA1P27694 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA1P27694 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA1P27694 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA1P27694 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA1P27694 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA1P27694 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPA1P27694 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPA1P27694 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPA1P27694 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPA1P27694 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA1P27694 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA1P27694 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms