Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNNI3P19429 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms