Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD53P19397 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD53P19397 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD53P19397 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD53P19397 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD53P19397 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD53P19397 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD53P19397 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms