Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCSHP14314 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCSHP14314 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCSHP14314 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCSHP14314 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCSHP14314 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCSHP14314 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms