Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRCP08575 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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