Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN3P07498 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSN3P07498 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN3P07498 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN3P07498 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN3P07498 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN3P07498 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN3P07498 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms