Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAP29O95721 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAP29O95721 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms