Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF1O95521 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms