Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSCO60682 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSCO60682 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSCO60682 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSCO60682 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSCO60682 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSCO60682 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSCO60682 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSCO60682 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSCO60682 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSCO60682 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSCO60682 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSCO60682 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSCO60682 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSCO60682 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSCO60682 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSCO60682 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSCO60682 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSCO60682 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSCO60682 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSCO60682 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSCO60682 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSCO60682 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSCO60682 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSCO60682 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSCO60682 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms