Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA2O43921 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms