Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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