Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNAB3O43448 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms