Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID2O43424 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID2O43424 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID2O43424 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID2O43424 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID2O43424 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID2O43424 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID2O43424 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID2O43424 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID2O43424 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID2O43424 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID2O43424 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID2O43424 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID2O43424 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID2O43424 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID2O43424 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID2O43424 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID2O43424 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms