Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms