Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FFAR3O14843 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FFAR3O14843 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR3O14843 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR3O14843 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms