Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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