Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM3A6NNA2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms