Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB19A4D1S5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB19A4D1S5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms