Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MIR219A2-202ENST00000385220 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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