Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KBTBD4-209ENST00000533290 3079 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF793-209ENST00000589319 1915 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HTR5A-AS1-201ENST00000395731 2703 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HYDIN-209ENST00000538248 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CPA6-201ENST00000297770 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 POTEE-205ENST00000626191 2027 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN1-201ENST00000372003 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IL7-201ENST00000263851 2076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZRSR1-201ENST00000391338 1673 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB6-203ENST00000409872 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FP700111.1-201ENST00000441760 2502 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 USF1-201ENST00000368019 998 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms