Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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