Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AC078850.1-201ENST00000514265 1623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 HTR3D-203ENST00000428798 1215 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 MRO-205ENST00000436348 1125 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 HTR3D-204ENST00000453435 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 RN7SL313P-201ENST00000497618 288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AL590556.2-201ENST00000637118 1162 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PES1P1-201ENST00000508165 1736 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 C10orf71-AS1-201ENST00000437677 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AC112492.3-201ENST00000457557 1031 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AL357060.2-204ENST00000448942 963 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 MXRA7-206ENST00000589082 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AC022146.2-201ENST00000605980 348 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 FAM230B-205ENST00000424410 1856 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SLC16A14P1-201ENST00000506846 1117 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AC137932.2-201ENST00000562995 1205 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 KCNAB1-203ENST00000389636 1806 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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