Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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