Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AP003108.3-201ENST00000623765 2234 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms