Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms