Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC112Q8NEF3 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC112Q8NEF3 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC112Q8NEF3 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC112Q8NEF3 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC112Q8NEF3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCDC112Q8NEF3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC112Q8NEF3 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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