Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAF6Q9Y4K3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAF6Q9Y4K3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms